在集装箱进口货运业务中，码头主要负责卸船(discharging)、箱货的暂时堆存(storage)、箱货的交付(delivery)等业务。全过程可分为四个阶段。
1.卸船前的准备
(1)收集整理进口资料。
为了确保集装箱船舶能及时靠泊和顺利卸货，船公司或代理需在规定的时间内向集装箱码头提供船舶动态信息和进口集装箱单证资料(edi报文)，以便为进口卸船作业做好充分的准备工作。因此，对于远洋航线定期班轮，一般要求船公司或其代理在船舶到港前72小时，向集装箱码头提供如下进口集装箱货运单证资料:
①进口舱单(cargo manifest);
②进口船图(bay plan);
③集装箱箱号清单(container list);
④危险品箱清单及准单(dangerouscargo list );⑤冷藏箱、特种箱和捎带散杂货清单;
⑥集装箱残损单(exceptionlist)。
对于近洋航线船舶，则要求船舶抵港前24小时，能通过传真形式，向集装箱码头发送货物和箱位信息，其内容如下:船箱位、提单号、箱型、箱号、货名、重量、整拼箱货物情况、收货人、合同号、特种货物资料等。如果船舶载有危险品货物，船公司或代理必须向海事局申请办理“危险货物载运申报单”手续，将其中的一份交给码头计划部门。
(2)制订船舶靠泊计划。
船公司在收到船舶从最后装运港寄来的集装箱货运资料后，应预计船舶到港时间，并将预计到港时间(eta)通知码头，同时船公司按集装箱码头要求，在规定时间内，尽早将有关进口集装箱货运资料送交集装箱码头。主要包括:
①船舶近期计划(目前基本不做);
②船舶昼夜计划。
(3)进口集装箱货运资料的签收。
集装箱码头的单证管理员收到船公司提供的进口集装箱货运资料后，要核数、签收、复印和分发。
(4)编制卸船计划。
码头计划员收到有关进口集装箱的货运资料后，应认真及时地进行分析、核对，然后根据计划靠泊方向，按船图编制集装箱卸船计划，即编制集装箱卸船顺序单。集装箱卸船顺序单按照集装箱的船箱位编制。编制的原则是由后往前、由上到下、由里向外，逐层编制。为了避免卸船作业出差错，要求最好一次编完。
为能尽量缩短船舶在港停泊时间，码头堆场必须制订进口卸船计划。集装箱船卸船作业与装船作业往往同时进行，因此，在制订计划时，必须同时考虑装船作业与卸船作业。
(5)安排堆存计划。
进口箱在码头堆场堆放得合理与否，不但会影响卸船计划的顺利进行，而且还会影响货主提箱，即交货计划的进行。码头堆场必须充分考虑进口集装箱的箱量、箱型、危险品、交货地等因素，制订合理的堆存计划(yard plan)。
在制订堆存计划时，一般要考虑以下几点堆存原则:
①不同尺寸的集装箱分开堆放;
②空箱与重箱分开堆放;
③整箱和拼箱分开堆放;
④同一提单号的大票货集中堆放;
⑤中转箱单独堆放;
⑥特种箱堆放在特种堆场;
⑦危险品箱堆放在危险品堆场;
⑧冷藏箱堆放在冷藏箱堆场。
堆场计划员根据上述堆存原则，在船舶作业开工前至少8小时，完成卸船堆存计划。
2.卸船作业
(1)核对计划。
船舶到港后，码头进口业务员或桥边指挥员上船向船方领取随船到港资料，包括船图、舱单资料，并向船方了解有关进口箱货位的实载情况。如果实载情况与原始资料有出入，应迅速调整卸船计划，同时更正相应的堆存计划。
(2)开工准备。
综合控制员在开工前将卸船顺序单、船图各一份交给船边验箱员;其余的交给桥边指挥员、堆场指挥员、外轮理货员。
卸船作业开始前半小时，装卸工拆除船上的绑扎，并协助验箱员和理货员检查箱子的外表状况。如发现集装箱有残损，验箱员和理货员要做好集装箱的设备交接单的缮制工作。双方认可后，各持一份。
(3)桥吊卸船及验箱。
卸船作业开始，船边验箱员按卸船顺序单上列明的卸船顺序，核对桥吊下的集装箱箱号，检查外表及铅封是否完好。如果箱号正确，外表及铅封完好，则在卸船顺序单上填上该箱的实卸时间;如果箱号有误或外表及铅封有损，则应该在该集装箱箱号后注明异常情况，并立即会同理货员向船方提出，请船方确认。然后，由外轮理货员加封、做好记录，并缮制设备交接单。集装箱如在装卸过程中有残损，应认真填制集装箱设备残损报告单，并由负责人签字。
(4)桥吊卸船及验箱。
桥吊司机将集装箱吊到等在码头前沿的集装箱拖车上，船边验箱员按卸船顺序单上列明的堆场计划箱位，指令集卡将箱运到指定堆场(目前，集卡通过无限终端获得指令)。
(5)堆场收箱。
卸船前控制室的场业控制员(场控)指挥轮胎吊到达指定堆场位置待命。集卡到达指定的堆场后，轮胎吊收箱。轮胎吊司机在箱落地后，将实际箱号和箱位及时通知控制室的控制文员，控制文员实时将箱号和箱位输入计算机内(目前，落箱信息通过无限终端由轮胎吊发送给场控)。
(6)复核和交接。
工班结束后，各当班人员应认真做好单证的复核、验箱和交接，上一班应向下一班交接完成情况以及未完成的作业。
3.卸船结束后小结
(1)编制进口集装箱单船小结。
船舶卸船结束后，配载室进口文员将实卸箱号清单同进口舱单资料进行核实，完成溢缺校对更正后，编制进口集装箱单船小结。小结的内容包括船名、航次、靠泊时间、总卸箱数、开工和完工时间、溢缺清单、残损清单等。
(2)编制进口卸船清单。编制进口卸船清单。
(3)资料汇总、分发、归档。
进口文员做完上述两项工作后，接着就要做交接工作，将全部单船进口资料和全部单证报表列明清单交单证管理员。单证包括:
①进口船图;
②进口舱单;
③卸船顺序单;
④进口卸船清单;
⑤残损箱“设备交接单”;
⑥进口单船小结;
⑦危险货物清单;
⑧集装箱残损单。
4.箱货的交付(整箱交付、拆箱交付)等
为了使集装箱码头的卸船工作能顺利进行，防止进口货物在码头堆场的积压，同时不使集装箱闲置，加速箱周转速度，在集装箱运输中，一般都由船公司先向收货人发出提货通知。收货人接到提货通知后，凭正本提单到船公司换取提货单，随附费用账单和交货记录两联。收货人持上述单证随其他进口货物报关、包验单证、办理完“一关三检”、放箱、理货和办完陆管处手续后，到码头办理提货手续。
码头箱货交付作业根据货物交付条款door、cy、cfs对应三种作业方式:整箱提运作业、拆箱车提(落驳)作业和仓库提货作业。